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La derrota de la U. S. Foggia, y su empate contra el Genoa 1893 -club que también luchaba por la permanencia- le valieron para mantenerse en la máxima categoría de nuevo por mejor diferencia de goles. En la campaña siguiente la escuadra viola pasó a ser el segundo equipo italiano en disputar la Copa de Europa de la UEFA -oficialmente Copa de Clubes Campeones Europeos-, y el primero del país que disputaba la final de la máxima competición de clubes de Europa. El delantero italiano recibió además la Bota de Oro al ser el máximo goleador en las ligas europeas, siendo hasta la fecha la primera y única vez que la ha recibido un jugador del club. Dichas buenas actuaciones estuvieron a punto de ser secundadas por el campeonato equipacion de la seleccion argentina liga la temporada siguiente tras finalizar a cinco puntos del campeón y repetir en la tercera plaza como su mejor resultado hasta que un par de años después las competiciones en el país hubieron de ser suspendidas por causas bélicas impidiendo el asentamiento de la estabilidad en el club. En 1946 el equipo participó en el campeonato de Tercera División donde alcanzó el subcampeonato.
Fichajes como los de Pozo del Manchester City o Chuli del Real Betis despertaron una gran ilusión en Almería por volver a Primera División, de hecho, el número de abonados fue de 10 832, descendiendo en apenas 200 abonados respecto al año anterior en Primera División. El curso se cerró además con un subcampeonato de Copa tras perder por la regla del gol visitante frente al Parma Associazione Calcio. La estrella del equipo era entonces el extremo derecho brasileño Júlio Botelho Julinho, quien ya había destacado en la Copa Mundial de Suiza 1954. El ariete estuvo acompañado por grandes jugadores como Giuliano Sarti, Ardico Magnini, Sergio Cervato, Giuseppe Chiappella, Francesco Rosetta, Armando Segato, Miguel Montuori, Giuseppe Virgili, Guido Gratton o Maurilio Prini entre otros, quienes marcarían hasta el momento la época más exitosa del club toscano a las órdenes de Fulvio Bernardini y la clásica formación inglesa “WM”. A la reciente final continental perdida se sumó el hecho de que el equipo juventino les arrebató a su gran figura, Roberto Baggio, por una cifra récord en la época que provocó disturbios en las calles de Florencia y que llevó su rivalidad al límite. El equipo cayó derrotado en los cuartos de final por los checoslovacos del Athletic Club Sparta -uno de los mejores equipos de Europa de la época conocido como el «Železná Sparta» (Sparta de hierro)-, a la postre campeones de aquella edición, por un 8-4 global en la eliminatoria.
Con contrataciones como la del campeón mundial Pedro Petrone -conocido como «el artillero»- se convirtió en uno de los más fuertes equipos italianos a comienzos de los años treinta, para terminar accediendo a la citada competición, la primera disputada a nivel internacional de clubes y en la fecha la única de carácter continental en Europa. La ida en el Stadio Comunale quedó casi sentenciada del lado turinés por 3-1. El tanto de Renato Buso y el referente Baggio daban esperanzas para el partido de vuelta en Florencia. Al igual que su anterior título liguero, únicamente perdieron un partido. Un subcampeonato en la Copa de los Alpes de 1970 precedió a una desafortunada actuación en el campeonato de Liga de 1970-71 que a punto estuvo de hacerle perder la categoría, pero se salvó milagrosamente en la última jornada por un mejor goal-average tras la derrota de la Unione Sportiva Foggia y el empate que cosecharon frente al Juventus F. C. en Turín. Dos años se mantuvo suspendida la Liga por la Segunda Guerra Mundial, por doce de la Copa, para reanudarse la competición en 1945-46 bajo la denominación de Campeonato de División Nacional Mixto ya que fue dividido en dos grupos, uno formado por equipos del Norte de Italia (y todos de la Serie A), y otro por equipos del Centro-Sur (pertenecientes a la Serie A y B), motivo por el que esta temporada no aparece en algunas fuentes como oficial.
Serie B de la Lega Serie A tras una nueva reforma del campeonato. El retorno a la Serie A en 1994 devolvió la ilusión al equipo viola que contrataron a jugadores como Rui Costa o Gabriel Batistuta dispuestos a recuperar la antigua gloria del equipo, hecho que no tardó en producirse. El suceso, en el que el club napolitano se ofreció a perder a cambio de favores económicos para evitar su quiebra a la vez que los toscanos necesitaban de esos puntos para acercarse al líder del campeonato -el Football Club Liberty de Bari- y lograr el ascenso a la División Nacional, fue descubierto días después y penalizado por la Federazione Italiana Giuoco Calcio – FIGC (Federación Italiana de Fútbol). Tras sendos empates a cero goles en sus dos enfrentamientos llegaron empatados a puntos a la última jornada. España quedó primera en el grupo, con un total de 26 puntos, y no cosechó ninguna derrota, sumando ocho victorias y dos empates y con 25 goles a favor y tan solo cuatro en contra. Tras los últimos años de fracasos, España participó nuevamente en una competición de gran importancia, el Mundial de 1978 de Argentina. Sin embargo, ese segundo subcampeonato le permitió disputar en la temporada 1959-60 la que sería la segunda competición europea de la UEFA: la Copa de Europa de Campeones de Copa, a la que accedieron los actuales campeones de las diferentes ediciones de Copa de toda Europa, y a la que el equipo viola llegó por haber caído en la final frente a la Juventus F. C., campeón de Liga y que por tanto disputó la Copa de Europa.